第四代祐念の時代、元和年間 (1615-1624)に眞光寺は広島城下に移転した。古い城下地図を見ると現在地より南の相生通辺りに眞光寺とあり禅宗とされている。当初の移転先はその場所でしかも禅宗の時期もあったのかもしれない。移転の経緯は明らかでないが、広島城築城以来、当時は仏護寺をはじめ多くの寺院が寺町に集められていた。時代の趨勢に乗って移転を余儀なくされたのであろう。

　寛永 7 年 (1630)、眞光寺は本願寺より木仏御本尊の裏書を下附され、正式に浄土真宗の末寺として寺号が認証された。後世、当時の住職祐念は「中興の開基」と称されている。

　第八代知宏は、眞光寺を大きく発展せしめた功労者である。新庄村(現在の山県郡 大朝町新庄)超専寺より入寺し、享保 15 年 (1730)、 本堂を新築し(同年 9 月 1 日上棟式挙行)、元文 元年 (1736) には梵鐘を新調したことが記録される。知宏の墓は今も境内墓地に残り、そこには「中興」と記して讃えられている。実際、過去帳の記 載によるとこの時期の門徒の数は急増しており、 知宏が中興と称される一端がうかがわれる。だから、眞光寺には中興が二人いることになる。

　第十代了恵の時代の明和5年(1768)、それまで「時應山（じおうさん）」と称していた山号が現在の「應時山（おうじさん）」と改 められている。どこまで正式な名称だったか疑わしいものだが、「應時」(時に応じて)という言葉は仏典 によく見られるが、「時應」という言葉はない。どこかで伝承が誤ったのかも知れない。

　現在地の本川流域には昔、上流から切り出された材木が集積する木場があり、寺近辺にも昭和40年代頃まで多くの木材業者が軒を連ねていた。そのためこの時代から上流の中調子（現在の安佐南区川内）や河口の元宇品などの林業、水運関係者や船大工のなどが多く門徒となって縁を結んでいた。